Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek3Q9R0A5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nek3Q9R0A5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek3Q9R0A5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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