Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fhl3Q9R059 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms