Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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