Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms