Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt3Q9QZ47 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnnt3Q9QZ47 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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