Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms