Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms