Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trp53inp1Q9QXE4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms