Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AatfQ9JKX4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms