Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga3Q9JJZ8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms