Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lmbr1Q9JIT0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms