Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn3Q9ES97 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtn3Q9ES97 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtn3Q9ES97 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn3Q9ES97 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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