Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms