Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tm9sf1Q9DBU0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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