Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc97Q9DBT3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc97Q9DBT3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc97Q9DBT3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc97Q9DBT3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc97Q9DBT3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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