Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcg8Q9DBM0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcg8Q9DBM0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms