Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms