Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34b2Q9D9N2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34b2Q9D9N2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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