Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms