Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx5Q9D8U8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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