Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Q9D8Q6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D8Q6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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