Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tspan13Q9D8C2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms