Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms