Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhl40Q9D783 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms