Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms