Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms