Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubxn11Q9D572 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms