Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm3404Q9D506 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3404Q9D506 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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