Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms