Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms