Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx20Q9D2Y5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms