Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms