Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trappc6bQ9D289 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trappc6bQ9D289 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trappc6bQ9D289 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trappc6bQ9D289 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Trappc6bQ9D289 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Trappc6bQ9D289 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Trappc6bQ9D289 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Trappc6bQ9D289 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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