Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms