Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snf8Q9CZ28 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Snf8Q9CZ28 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms