Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gtpbp8Q9CY28 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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