Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PmpcbQ9CXT8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PmpcbQ9CXT8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PmpcbQ9CXT8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PmpcbQ9CXT8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms