Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Utp23Q9CX11 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms