Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddx28Q9CWT6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx28Q9CWT6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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