Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Sycp2Q9CUU3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp2Q9CUU3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms