Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NenfQ9CQ45 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NenfQ9CQ45 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms