Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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