Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms