Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mrpl43Q99N89 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms