Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms