Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp16Q99LG0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp16Q99LG0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms