Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms