Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pacsin3Q99JB8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms