Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim11aQ99J19 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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