Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim59Q922Y2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms